Trong số những người định cư đầu tiên có nguồn gốc châu Âu ở khu vực Clinton có Elijah Buell, người đã xây dựng một căn nhà gỗ vào ngày 25 tháng 7 năm 1835 và vào năm 1837, thành lập thị trấn Lyons, được đặt theo tên của thành phố cùng tên của Pháp. Buell hợp tác với một John Baker trong một dịch vụ phà thành công qua sông Mississippi , tại một địa điểm có tên là "Narrow", giữa Lyons và nơi sẽ trở thành thành phố Fulton, Illinois .  Mặc dù Lyons phát triển nhanh chóng và thịnh vượng, cuối cùng nó đã sáp nhập vào thành phố Clinton.

Clinton đã được đặt tên là thị trấn New York vào năm 1836 bởi Joseph Bartlett.  Bartlett tin rằng khu vực này rất giàu có Trầm tích vàng và ông đã chuẩn bị cho một thị trấn bùng nổ để phát triển. Trong khi chờ đợi "sự bùng nổ vàng" thành hiện thực, Bartlett đã bắt đầu một dịch vụ phà thứ hai băng qua Mississippi đến làng Albany, Illinois . Tuy nhiên, dịch vụ của anh không phổ biến như Buell's ở Lyons. Bartlett sớm chán nản và bán tài sản của mình.  Vào tháng 3 năm 1837, Noble và Sarah Gregory Perrin đã mua 136 mẫu đất (0,55 km 2 ) ở nơi hiện là bà Clinton và nuôi gia đình trong một căn nhà nằm ở dưới chân cầu đường sắt.  Eve Con gái lớn của họ, Valeria, kết hôn với Tiến sĩ Augustus Lafayette Ankeny, người đã tham gia vào cuộc chiến Blackhawk và đến Lyons vào tháng 4 năm 1850.

Mary Perrin, sinh ngày 26 tháng 9 năm 1837, là con cái đầu tiên của tổ tiên châu Âu sinh ra ở Hạt Clinton. Vào năm 1839, như ở hầu hết các thị trấn đầu sông, thị trấn bao gồm một cabin, hai cửa hàng và một quán rượu. Năm 1855, Đường sắt Chicago, Iowa, Nebraska tuyên bố sẽ băng qua sông tại Đảo Little Rock liền kề với khu định cư của Bartlett. Công ty Iowa Land được tổ chức vào ngày 26 tháng 5 năm 1855 và vào ngày 4 tháng 7, đã mua đường của Bartlett và đổi tên thành Clinton, để vinh danh DeWitt Clinton , thống đốc hai lần của New York và là một trong những động lực thúc đẩy việc xây dựng Erie Kênh đào .

Năm 1840, Quận Clinton được chính thức tổ chức; ngôi làng Camanche , nằm ở hạ lưu từ "New York" của Bartlett, trở thành quận lỵ đầu tiên. Thỏa thuận sẽ trở thành bà Clinton không thay đổi nhiều vào những năm 1840, nhưng Lyons vẫn tiếp tục phát triển và thịnh vượng. Đến năm 1852, các dòng stagecoach chạy từ Lyons đến Davenport , 30 dặm (48 km) về phía Tây Nam; đến thành phố Iowa , 71 dặm (114 km) về phía Tây; và đến Dubuque, 51 dặm (82 km) về phía Tây Bắc. Cùng năm đó, Công ty Đường sắt Trung tâm Lyons và Iowa được thành lập, dẫn đầu bởi một HP Adams. Công việc bắt đầu trên đường sắt gần như ngay lập tức, và tiến triển nhanh chóng. Tuy nhiên, số tiền gây quỹ để xây dựng đường dây là không đủ; một số đã bị lạm dụng Liên doanh cuối cùng đã thất bại. Tuyến đường sắt bị chê bai là "Tuyến Calico", sau khi số lượng lớn vải calico được bán tại cửa hàng của công ty ở Lyons. Nhưng viễn cảnh về một tuyến đường sắt đến Lyons, và có khả năng băng qua Mississippi tại Narrow sẽ theo sau, đã gây ra sự tăng trưởng nhanh chóng trong cộng đồng. Dân số của Lyons tăng từ 200 người vào năm 1852, lên hơn 5.000 vào năm 1858.

Vào ngày 10 tháng 11 năm 1855, chiếc xe đầu tiên của thành phố Clinton được ký kết; chiếc máy được khảo sát dưới sự chỉ đạo của Charles B. Stuart, một kỹ sư dân sự đến từ New York, với sự hỗ trợ của William Rumble, kỹ sư và CI Loring, người vẽ phác thảo. Vào ngày 26 tháng 1 năm 1857, thành phố đã được cấp một điều lệ và vào ngày 7 tháng 3, điều lệ đã được thông qua. Vào ngày 5 tháng Tư năm 1859, điều lệ sửa đổi của thành phố đã được thông qua, kéo dài cho đến khi một điều lệ chung được thông qua vào năm 1867

Một thông báo được đưa ra vào năm 1855 rằng một tuyến đường sắt đã đi qua Mississippi, South of Lyons, tại Little Rock Island. Đồng thời, Công ty Đất đai Iowa (ILC) được thành lập. ILC đã mua đường của Bartlett trên bờ Iowa đối diện Đảo Little Rock. Đồng thời, Đường sắt Chicago, Iowa, & Nebraska (C & IN) được thành lập, với mục đích rõ ràng là vượt sông Mississippi tại Clinton. Xây dựng trên cây cầu đường sắt bắt đầu vào năm 1856, và dân số của bà Clinton đã tăng lên hơn 1.000 khi việc xây dựng tiếp tục. Vào tháng 6 năm 1859, tuyến đường sắt đã được hoàn thành đến Cedar Rapids. Chuyến tàu đầu tiên băng qua từ bờ biển Illinois đến Đảo Little Rock vào trưa ngày 9 tháng 1 năm 1860 và được đưa lên bờ từ bờ biển Iowa. Vào tháng 1 năm 1864,

Cũng trong năm 1864, Đường sắt C & IN đã sáp nhập với Đường sắt Liên minh Galena & Chicago để tạo thành Đường sắt Chicago & Tây Bắc (C & NW). Theo hướng Bắc-Nam, sự phát triển đường sắt cũng tiếp tục. Năm 1868, C & NW đã xây dựng một đường nhánh kết nối Lyons với tuyến đường sắt Đông-Tây tại Clinton. Năm 1870, Công ty Midland Iowa đã xây dựng một tuyến đường sắt từ Lyons đến Anamosa, Iowa , cách 59 km (95 km) về phía Tây Bắc. Tuyến đường sắt này sau đó đã được C & NW tiếp thu. Năm 1872, Đường sắt Chicago, Clinton, & Dubuque (CC & D) được xây dựng ở phía Bắc từ Lyons. Nó trở thành một phần của Đường Milwaukee ; nó mở rộng một dòng Nam đến Clinton. Tuyến đường sắt cuối cùng ở Clinton, Davenport, Rock Island và Tây Bắc, đã được hoàn thành từ phía Tây Nam dọc theo Sông Mississippi đến Clinton vào năm 1901. Một tuyến đường sắt chở khách liên thành phố (Đường sắt Clinton, Davenport và Muscatine) hoạt động dọc theo tuyến đường này vào cuối năm 1940. Đường bên phải này, cùng với đó là CC & D trước đây, hiện đang được vận hành bởi Canada National .

Năm 1869, do tầm quan trọng của nó như là một trung tâm giao thông chính, ghế quận đã được chuyển đến Clinton; nó đã ở đó từ bao giờ Các Clinton County Court House , tọa lạc tại 612 đường Bắc 2, được thiết kế bởi G. Stanley Mansfield, Kiến trúc sư, của Freeport, Illinois , và Josiah L. Rice, Giám sát kiến trúc sư, của Clinton. Nó được xây dựng từ năm 1892 đến 1897.

Trường công lập đầu tiên ở Clinton được tiến hành tại một ngôi nhà gỗ gần nhà máy thượng lưu WJ Young. Nó được dựng lên vào mùa đông năm 1855-56 và Isaac Baldwin là giáo viên đầu tiên của nó. Trường Thánh Irenaeus được khai trương vào năm 1852.

Cầu Lyons-Fulton ban đầu được xây dựng vào năm 1891 (được thay thế bằng Cầu tưởng niệm Mark N. Morris năm 1975), sau đó là Cầu cao Clinton năm 1892 (được thay thế bằng Cầu Gateway năm 1956).

Giữa những năm 1850 và 1900, các thành phố Lyons và Clinton nhanh chóng trở thành trung tâm của ngành công nghiệp gỗ và được coi là "Thủ đô gỗ của thế giới". Những chiếc bè gỗ khổng lồ được thả trôi xuống sông từ Wisconsin và Minnesota, được cắt thành gỗ tại Clinton, sau đó được chuyển đến các cộng đồng đang phát triển thông qua sông và đường sắt. Các công ty thuộc sở hữu của các gia đình WJ Young , Chancy Lamb , George M. và Charles F. Curtis ( Curtis Bros. & Co ), David Joyce , Silas W. Gardiner Lyons và Friedrich Weyerhäuser sớm trở thành một trong những gia đình lớn nhất trong cả nước. Trong những năm 1880 và 1890, bà Clinton đã khoe khoang 13 triệu phú thường trú, nhiều triệu phú trên đầu người hơn bất kỳ thị trấn hay thành phố nào khác trên toàn quốc.

Năm 1877, nghệ sĩ dương cầm nổi tiếng Carl Lachmund đã thành lập Nhạc viện âm nhạc Đức tại Clinton.

Bữa tiệc lớn nhất, công phu nhất từng được tổ chức tại Clinton đã tổ chức lễ ra mắt Emma Lamb và kỷ niệm ngày cưới lần thứ hai mươi của cha mẹ cô, Artemus và Henrietta Sabrina Smith Lamb vào ngày 13 tháng 10 năm 1885. Fellow lumber baron , vợ và con gái của ông đã tham dự cùng với Hàng trăm khách tất cả đều mặc trang phục chính thức.

Năm 1895, Lyons chính thức sáp nhập với Thành phố Clinton.

Thời đại của sự sang trọng đã kết thúc vào năm 1900, khi các khu rừng phía bắc bị cạn kiệt. Các xưởng cưa đóng cửa, nhưng đường sắt và sông, cung cấp vận chuyển kinh tế theo mọi hướng, thu hút sản xuất và công nghiệp nặng. Thành phố vẫn tự hào có một số lâu đài Victoria tráng lệ, bao gồm cả biệt thự Curtis, hiện là nhà của Câu lạc bộ phụ nữ Clinton.

Các Hiệp hội bảo vệ Mỹ (APA) được thành lập năm Clinton vào ngày 13 Tháng Ba năm 1887 bởi luật sư Henry Francis Bowers .

Năm 1941, với việc Howard Judd làm huấn luyện viên, trường trung học Clinton đã giành được chức vô địch đầu tiên trong số 11 giải vô địch tiểu bang về bơi lội.  Chuỗi này bao gồm năm chức vô địch liên tiếp từ năm 1954 đến 1958 và tạo ra 39 cá nhân Tất cả người Mỹ và 14 Đội tiếp sức cá nhân người Mỹ (Chương trình tiếp nhận câu chuyện Howard Judd ngày 5 tháng 6 năm 1966). Thành công về thể thao của bà Clinton đã được thêm vào năm 1953 khi St. Mary giành chức vô địch bóng rổ nhà nước.

Những chiến thắng thể thao tuyệt vời khác đã đạt được bởi đội bóng chày của các nam sinh trường trung học 1964 của Clinton đã giành giải vô địch quốc gia, những người khổng lồ của Clinton năm 1991 đã giành chức vô địch bóng chày ở Trung Tây League và bởi đội bóng rổ của các nam sinh trường trung học năm 1992 (được gọi là '92 phi hành đoàn ) giành giải vô địch quốc gia.

Vào ngày 27 tháng 4 năm 1951, Mississippi mào ở độ cao 20,7 feet (6,3 m); sau đó vào ngày 26 tháng 4 năm 1952, nó lại xuất hiện ở độ cao 20,9 feet (6,4 m). Tất cả những điều đó là một bài tập so với đỉnh vào ngày 28 tháng 4 năm 1965, ở độ cao 24,85 feet (7,57 m) là mức cao nhất từng được ghi nhận.

Việc xây dựng Cầu Cổng (Illinois-Iowa) được bắt đầu vào tháng 8 năm 1954, hoàn thành vào tháng 5 năm 1956. Nó được khánh thành vào ngày 1 tháng 7 năm 1956.

Năm 2005, bà Clinton, cùng với Coon Rapids, Iowa và Sioux City , đã được trao tặng một trong những danh hiệu khai mạc của Iowa Great Địa điểm.  Giải thưởng này mang lại cho bà Clinton khoản phân bổ ngân sách nhà nước trị giá 1 triệu đô la để cải thiện văn hóa và cảnh quan dọc theo bờ sông của thành phố.

Vào năm 2009, Archer Daniels Midland đã bắt đầu xây dựng một nhà máy đồng phát mới để cung cấp cho nhu cầu điện của mình, đốt than và ngô thừa để lấy năng lượng. Nhà máy đồng phát mới đã lên mạng vào năm 2010